新生儿肺炎的发病原因是由于滞产，胎膜早破，肛门括约肌松弛排出胎粪，胎儿吸入污染羊水，巨细胞病毒、克萨奇B、疱疹、风疹病毒、肠道杆菌、葡萄球菌、肺炎双球菌乘虚而入；新生儿咽部运动功能不协调，喂乳时部分乳汁进入气管；先天性食管闭锁，口腔分泌物及乳汁直接进入肺部等因素造成。