本病的发生由伤寒杆菌和副伤寒甲、乙、丙沙门氏菌随饮食入胃，如细菌未被胃酸杀灭，穿过小肠粘膜至小肠上部肠壁淋巴组织生长繁殖，后经胸导管及门脉入血，形成初期菌血症。细菌继随血流散布肝、脾、骨髓、淋巴结等网状内皮细胞内继续繁殖，进入第二期菌血症，出现临床症状。进入肝胆系统的细菌在胆囊内大量繁殖，向肠道排出，不断在肠肝内反复循环，使肿胀的小肠淋巴组织发生强烈的过敏反应，肠壁淋巴结由增生转为坏死，形成溃疡，甚至发生肠出血和肠穿孔。本病潜伏期3～25天，平均10天。副伤寒潜伏期较短。自然病程4周。诊断主要依据临床特征、肥达氏反应(菌体抗原0效价在1:80以上，鞭毛抗原H效价在1:160以上才有诊断意义)及细菌培养(血液、骨髓、粪、尿)阳性。
现代医学对本病的治疗主要采用抗菌药物及对症处理。当病情较严重、毒血症明显，体温高而持续长时，可适当加用激素或其它方法。
