子宫内膜异位症往往发生在子宫直肠窝或阴道直肠膈的部位。其临床症状常随内膜异位部位不同而各异。主要表现为下腹疼痛，甚至牵引阴道、尾骶以及肛门直肠之间，有剧烈的坠胀痛及性交痛，也有的幅射痛至上腹部或胁肋部等处。疼痛拒按，病久则喜按。如果子宫内膜异位发生在宫体，则宫体增大，子宫收缩行经时而见经量过多，且经量过多痛愈剧。亦有些病人，无痛经史，只是在妇科检查或手术时，才发现子宫内膜异位。